Les écrits de Calvin se diffusaient discrètement ; les opinions se partageaient entre les réformistes convaincus, les tièdes et les fidèles à la tradition romaine. Ici ou là, en Morvan, des menées contre des catholiques avaient lieu ; les fautifs étaient brûlés ou roués.

Dans la seconde moitié du XVIème siècle, la Réforme est organisée en Morvan. Les seigneurs morvandiaux, jaloux des possessions des ecclésiastiques, se rallient en nombre à la Réforme, parfois pour pouvoir mieux piller les abbayes. Des prêches s'organisent dans les châteaux, comme dans celui de Conforgien, des temples et des cimetières protestants sont autorisés puis très vite fermés. Ce n'est qu'après l'Edit de Nantes (1598), qui admet la tolérance envers les protestants, que les temples sont clairement reconnus. Avant le culte restait souvent secret par crainte des représailles.

Après la révocation de l'Edit de Nantes en 1685, de nombreux huguenots morvandiaux fuirent vers la Suisse, pays de la Réforme, qui n'était qu'à trois ou quatre journées de marche. Les communautés protestantes ne purent se reconstituer tant les catholiques étaient hostiles et parce que les seigneurs qui les dirigeaient avaient fui ou abjuré pour sauver leurs biens.

Conforgien haut-lieu protestant